社團法人國家生技醫療產業策進會(簡稱：生策會)自2014年開始推動SNQ國家品質標章，以嚴謹、專業的科學驗證審查，將與健康息息相關的醫療照護服務等等加以把關其安全與品質，透過檢視醫療院所內各團隊客觀的醫療指標，並從病人身上證實醫院的服務成果，評核出醫院的醫療品質、發掘醫師的強項、優秀的護理團隊及關心病人感受，並將優秀的項目提供給民眾認識，做為就醫的實質參考，本院秉持誠信、當責、創新的核心價值，多項醫療服務皆有獲得SNQ標章認證。
ISO是國際標準化組織（International Organization for Standardization）的簡稱，其宗旨是通過制訂和評審國際標準。1987年公佈的ISO 9000系列品質管理制度適用於全世界各行各業提高其產品、工程或服務的品質層次，進而達到世界認可的水平。
ISO 9001系列的標準強調「顧客為重」、「過程導向」及「績效管理」精神。當組織採用過程管理，依計劃-執行-檢查-行動(PDCA)的管理循環模式，提供符合顧客期望的服務，達到顧客滿意的目的，並藉績效管理提昇組織的應變力及競爭力，達到企業永續經營之目的。本院臨床診療科於2008年1月率先通過台灣檢驗科技股份有限公司（SGS）ISO 9001：2000品質管理系統驗證。
而在院方鼎力支持和全員參與下，品質管理部歷經一年的努力，由擬定品質政策、設定品質目標、跨科的流程整合，制定標準作業的四階文件管理機制，並藉指標量測分析和內部稽核的活動，確認「說」「寫」「作」一致的落實和達到持續改善；經由顧客滿意度的調查，確認提供的服務符合民眾的期待。2011年5月20日通過法國標準協會艾法諾集團貝爾國際驗證公司ISO 9001：2008品質管理系統驗證，2017年8月7日通過ISO 9001：2015版認證，完成以流程和顧客為導向及系統性的持續改善的全面品質管理制度。
臨床病理科2006年4月通過
放射免疫室2008年3月通過
細胞學科2012年10月通過
ISO/IEC 27001：2013資訊安全管理系統(2023年3月通過)
行動應用App基本資安檢測基準(2022年7月通過)