本科業務涵蓋面甚廣，包括胃腸外科、肝膽胰外科、內分泌外科、食道及胸腔外科、小兒外科、內視鏡外科、腫瘤外科等。治療之疾病包括一般皮下組織或深部組織之良性及惡性腫瘤，軟組織之感染疾病，甲狀腺腫瘤、癌症、內分泌功能異常疾病、乳房腫瘤、乳癌、乳房硬塊、乳頭分泌物、乳房感染之問題。內臟腫瘤：包括食道癌、肺癌、胃癌、十二指腸癌、腸癌、大腸結腸癌、直腸癌之手術治療，肝硬化食道靜脈瘤、肝腫瘤、肝癌、膽結石、總膽管結石、肝內結石、膽囊癌、膽管癌、胰臟癌等其他重症之手術，消化道之大量出血治療，急性腹部外科、小兒外科、疝氣、隱睪、先天性畸形，腫瘤等諸多手術不勝枚舉。目前由於病患年齡層老化，心血管疾病病例增多，甚多腸系膜血管病變引發腸壞疽，腹膜炎休克之病例及大量消化道出血病例，皆在本科醫療範圍。 本科除本院門診、住院、重症加護病房之服務外，亦支援各有關醫教合作之醫療機構，如三重縣立醫院、署立基隆醫院、台北市立聯合醫院婦幼院區……等，接受重症病患之後送及救治，同時亦積極參予各醫學中心及衛生署、國科會等主辦之各項癌症研究。
